选择繁殖亲鱼要注意体质是否健壮，各鳍（尤其是尾鳍）是否长大而舒展，体色是否鲜明，花纹特征是否明显，色彩是否纯正等。有了优良品种就可开始做准备工作。通常孔雀鱼长到4个月就可让其交配。
2、繁殖水族箱
选择一个较大的水族箱，注入理化特性适宜的水（pH值为6.8～7.4，硬度适当，水温24～27℃），盛水八成。箱底种水草或放置香蕉叶，然后按雌、雄1:2～3的比例投放亲鱼。用鱼虫等营养丰富、适口性好的饲料喂养，日投4次。
3、产卵
孔雀鱼为卵胎生，繁殖能力很强。一般4～5月龄便达性成熟，此时雄鱼臀鳍部分鳍条演化成尖形的输精器；雌鱼腹部明显膨大凸出，在臀鳍上前方的腹部近肛门处出现一块黑斑，这块黑色肿斑是临产的征兆，其颜色越黑表明越近临产时间。
发情期雄鱼尾部展开好似“孔雀开屏”，用斑烂的色彩来吸引雌鱼，并追逐雌鱼。交尾时，雄鱼用交接器前端的钩状物钩住雌鱼的生殖孔；交尾时间每次约一秒钟，但次数较频繁。待其交尾后将雄鱼取出，雌鱼可连续生殖数次。
雌鱼产仔数视其个体大小和年龄而异，少则20尾，多则100余尾。小鱼产出后就会游泳和捕食。第一周投喂的饲料可用纤毛虫与丰年虫，第二周喂丝蚯蚓与干饲料。第一周内的幼鱼饲养要特别仔细，因为这一阶段饲养好坏对幼鱼以后的发育影响极大。
产后雌鱼单独静养3～5d，以免过早被雄鱼追逐而受伤。幼鱼长到3～4周龄时可瓣出雌雄，并有交配能力。为了保证子代健壮，雌雄鱼必须分开饲养。孔雀鱼的寿命短，2～3年便已衰老，雄鱼的寿命较雌鱼更短。
4、品系控制
为获得奇异而漂亮的孔雀鱼，选种上采用两种方法：一是近亲繁殖（in——breeding），二是品系繁殖（line—breeding）。近亲繁殖是指有密切血统关系的个体之间进行交配，这种方法可以净化和固定遗传形质，以产生一个品系。但此种方法不宜连续采用超过4代，否则会因遗传异而出现生理缺陷，如鱼体变小、繁殖力减退、色泽不美等。品系繁殖是让有血缘相关的鱼相互交配，但血缘关系并不很密切，采用这种方法 可以把一个固定的品系继续不断地繁殖下去。
为维持优良品系，应严防混交、乱交，故雌雄鱼必须分养；在需要的时候，选择适当的亲鱼放入水族箱内进行繁殖，并作好记录——何种雌鱼与何种雄鱼进行杂交，以便日后选取何种性别的鱼与它们的后代进行回交。