近亲繁殖对养猪来说，也会带来危害。但大多数农民养猪出现问题时，很少有人会从近亲繁殖方面考虑。
笔者在调查中发现，许多饲养户并不清楚自家饲养的公猪、母猪能与哪些种猪交配。饲养母猪的农民，多数是将母猪牵到附近农民饲养的公猪那里交配，或人工授精；饲养公猪的农民，只要有母猪来，就让公猪与其交配，或出售公猪的精子。至于是否属于近亲繁殖，很少有人过问，一般肉猪饲养户更没有这个概念。有的地方竟出现同一父系的公、母猪交配，或同一母系的公、母猪交配，有些公猪先后与同一母系或同一父系的几代母猪交配。
生猪近亲繁殖的后代发病率高，抵抗力差，生长速度只相当于非近亲繁殖猪的50%。有的猪饲养8个月体重才100公斤；有的是畸形、弯脚，不能站立；有的有疝气。至于猪肉营养是否受到影响，有待研究。
许多乡镇畜牧兽医站都是以阉割、治病、防疫为主，对于科学配种问题管理少，指导监督少，致使生猪配种市场出现无序状态，出现近亲繁殖现象。
针对以上情况，养猪专家建议，农业（畜牧业）部门和兽医部门要重视生猪品种改良工作。乡镇畜牧兽医站要对本乡镇公猪、母猪进行全面普查，建立种猪档案，提出科学配种方案和防止近亲配种的具体细则，同时向种猪饲养户提供历次交配记录。母猪养殖户要向前来购买仔猪的农户提供非近亲繁殖的证明资料。乡镇兽医站要采取多种形式向农民宣传生猪近亲繁殖的危害，指导养猪户避免近亲繁殖，不购买、不饲养近亲繁殖的生猪。
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